• Jednostki ETF są kupowane i sprzedawane tak jak akcje, zatem obowiązuje prowizja od transakcji. Wysokość prowizji należy uwzględnić przy podejmowaniu decyzji inwestycyjnych.
• ETF-y są tak płynne (łatwo zbywalne) jak instrumenty, o które są oparte. W latach 90-tych wobec problemów na rynku walutowym w Malezji, przejściowo utrudniona była sprzedaż akcji na tamtejszym rynku, a co za tym idzie sprzedaż ETF-ów. Są to jednak odosobnione przypadki i zarówno instytucje zarządzające jak i nadzór państwowy dokłada wszelkich starań, aby ETF-y były pod względem obrotu jak najbardziej bezpieczne.
• ETF a kwestia systematycznego oszczędzania - strategia ta dobrze sprawdza się jedynie w funduszach zwykłych, w przypadku ETF prowizja może stanowić zbyt dużą cześć wpłacanej kwoty. Innymi słowy w przypadku wpłacania kwot rzędu 200.00 PLN miesięcznie lepiej wybrać zwykły fundusz. Natomiast przy kwotach rzędu 2 000.00 PLN miesięcznie warto rozważyć wybór ETF, gdyż kluczową rolę zaczyna odgrywać wysokość opłaty za zarządzanie, która jak już wspomniano, jest nieporównywalnie niższa niż w zwykłych funduszach.
• Ostatnią ważną kwestią jest ryzyko walutowe. Przy inwestycjach zagranicznych stopa zwrotu uzależniona jest zarówno od wahań cen samej jednostki, jak i wahań kursu walutowego. Może się bowiem okazać, że na jednostce inwestor zarobi, ale na skutek ruchów na rynku walutowym straci.